Pada 22 April 2012, Batshuayi mendapat kartu merah saat kalah 3-2 di Genk karena menginjak dada Jeroen Simaeys dengan Asosiasi Sepak Bola Kerajaan Belgia menangguhkannya untuk empat pertandingan berikutnya.
Pada 25 September 2012, Batshuayi kembali dikeluarkan dari lapangan dalam kemenangan 3-2 di Mouscron di babak keenam piala Belgia, setelah menyikut Benjamin Delacourt dalam setengah jam pertama. Hal ini mengakibatkan larangan 2 pertandingan dalam kompetisi dan didenda €200.
Michy Batshuayi melakukan debutnya di tim utama bersama klub Belgia Standard Liège pada tahun 2011. Dia tampil dalam total 144 pertandingan dalam tiga setengah tahun tugasnya di klub dengan mencetak 44 gol.
Itu diikuti oleh transfer £ 4,5 juta ke tim Prancis Marseille. 2 musim yang dia ikuti sangat penting saat dia bermain dalam 78 pertandingan dan mencetak 33 gol.
Dia menolak Crystal Palace untuk pindah ke sesama klub Liga Premier Chelsea seharga £ 33,2 juta untuk bermain bersama playmaker Brazil Oscar.
Pada musim 2013-2014, Batshuayi mencetak 21 gol dalam 34 pertandingan, menempatkannya tepat di belakang Hamdi Harbaoui dari Lokeren untuk pencetak gol terbanyak liga yang telah mencetak 22 gol.
Baca Juga: Inilah Sumber Kekayaan Cristiano Ronaldo, Meski Diisukan Pensiun Usai Piala Dunia Qatar 2022
Pada 8 Agustus 2014, Batshuayi ditandatangani oleh pakaian Prancis Marseille dengan harga £ 4,5 juta yang dilaporkan.
Pada 29 Oktober dia mencetak gol pertamanya untuk klub dalam kekalahan 2-1 di Rennes di putaran ketiga Coupe de la Ligue.